Le sultan Mérinide Abu Youssef Yakoub choisit le site de Chellah (Sala Colonia) et décida d'y construire une mosquée au milieu de ses ruines. Il y fut enterré en 1286 ainsi que sa femme et après lui quatre de ses successeurs.
Au centre de la nécropole, il ne reste que quelques pans de mur de la Zouïa. Cet établissement religieux était tout à la fois une mosquée, une école coranique et un centre d'hébergement pour les pélerins et les étudiants. Selon certains auteurs, cette Zouïa était encore plus luxueuse que les medersa de Fès dont elle avait les mêmes principes de construction.